幹人の家は、祖父が神主をつとめる猫丸神社。ある日、学校の調べ学習で、おとなしい結衣とクラスで浮いている想太の３人で猫丸神社を調べることになる。
しかし、祖父はくわしく知らず、図書館の郷土史コーナーや郷土資料館へ行っても、なぜか資料が見つからない。幹人は調べ続けるのをためらうが、「猫丸神社が好きだ」と言う２人に背中をおされ、猫丸神社にかくされたひみつをつきとめる決心をする。